结束沙之都的冒险后，亚特鲁与多奇为赚取旅费也节省交通费用，登上前往艾雷西亚的定期客轮“伦巴底号”，打工的同时也寻找前往的阿尔塔戈公国的机会。
然而客轮在行经盖提海恶名昭彰的神秘无人岛“赛连岛”附近海域时遭到不明的巨大触手袭击沉没，亚特鲁、多奇与“伦巴底号”的船员乘客因此漂流到了神秘的赛连岛上。
要成功脱离无人岛，漂流者们必须弄清楚巨大触手的本体，却意外发现沉睡在赛连岛上的古文明“耶坦尼亚王国”的遗迹，而亚特鲁也因为不明原因与古耶坦尼亚的宗教最高领袖“巨树巫女”产生了意识链接。
为了求生，亚特鲁等人在神秘的赛连岛上展开了一连串的冒险，调查幽灵船与古文明的消失之谜。